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tesis Acceso Abierto

Estudios genéticos y moleculares sobre la biosíntesis de los glucanos Beta (1,2) cíclicos en Rhizobiaceae

Olga Alejandra Castro ; Luis Ielpi

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Fil:Castro, Olga Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
tesis Acceso Abierto

Estudios genómicos y caracterización funcional de rizobios tipo Oregon noduladores de alfalfa y otras leguminosas

Gonzalo Arturo Torres Tejerizo ; Mariano Pistorio ; Antonio Lagares

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Cobertura temática

Debido a sus características particulares fenotípicas y taxonómicas, los rizobios tipo Oregon han atraído la atención de los rizobiólogos desde su aislamiento original por Eardly et al. (1985) en Oregon, USA. Estos rizobios son tolerantes a la acidez, tienen un rango de hospedadores amplio (nodulan varias leguminosas), son muy competitivos para la nodulación de alfalfa en suelos ácidos y son ineficientes para la fijación de nitrógeno en asociación con la alfalfa. Todos estos factores señalan a este grupo de rizobios como un potencial factor de riesgo en los suelos agrícolas en los que coexisten y compiten con E. meliloti, el simbionte eficiente de alfalfa. Nueva información sobre la genética y fisiología de las bacterias tipo Oregon es necesaria para desarrollar mejores estrategias y herramientas (moleculares) para su detección, para comprender de modo más acabado su ecología en suelos de cultivo, y para minimizar los impactos sobre la simbiosis eficiente entre alfalfa y E. meliloti. Objetivos Generales: Abordar estudios genómicos y caracterizar funcionalmente a los rizobios tipo Oregon, noduladores de alfalfa y otras leguminosas, tolerantes a la acidez e ineficientes en la fijación biológica de nitrógeno. Objetivos Específicos: - Obtener el genoma completo de la cepa Rhizobium sp. LPU83, como el representante mejor caracterizado de los rizobios tipo Oregon. - Realizar el análisis funcional in silico del nuevo genoma y evaluar, comparativamente, marcadores cromosomales y plasmídicos respecto de sus homólogos en otros rizobios con el fin de establecer relaciones funcionales y filogenéticas con otras rizobacterias. - Analizar la información contenida en plásmidos, y su transmisibilidad por vía conjugativa. - Determinar la estructura de los factores de nodulación de las rizobios tipo Oregon como determinantes de especificidad para la nodulación de alfalfa. Explorar las relaciones estructurales de los factores de nodulación con los de otros rizobios, especialmente los noduladores de Medicago spp. y Phaseolus vulgaris.
tesis Acceso Abierto

Estudios genómicos y funcionales en Anaplasma marginale y en bacterias intracelulares de la clase alfa-proteobacteria y su relación con la reducción del genoma

Pablo Alfredo Nuñez ; Marisa Farber

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Cobertura temática

La subdivisión α- de la clase proteobacteria representa un grupo sumamente diverso y heterogéneo de bacterias con una gran variabilidad en sus características genómicas, biológicas y ecológicas. Dentro de esta subdivisión se encuentra el orden Rickettsiales que ha cobrado gran importancia durante los últimos años por agrupar a diversos patógenos emergentes que resultan relevantes para la salud pública y salud animal. Entre ellos, se destaca Anaplasma marginale, causante de la Anaplasmosis bovina enfermedad transmitida por garrapatas que tiene gran impacto sobre la actividad ganadera en nuestro país. Es importante concentrar esfuerzos en comprender mejor las preguntas: ¿Qué tienen en común y en qué difieren estos organismos en términos de información en el genoma y en su biología? ¿Podemos identificar y explicar las diferencias en sus capacidades de adaptación en términos del contenido génico y la conservación de la estructura y función de determinados mecanismos moleculares? Este trabajo se centra en aspectos inmunológicos, funcionales y evolutivos tomando como modelo a A. marginale y analizando comparativamente organismos relacionados del orden Rickettsiales en el contexto de la clase α-proteobacteria. La caracterización del conjunto de proteínas de membrana externa y de los sistemas de secreción representa un desafío importante por ser los principales blancos de interacción de las bacterias con las células hospedadoras y con las células del sistema inmune. Este estudio permitió la identificación de dos proteínas en A. marginale con capacidad antigénica que fueron capaces de estimular una respuesta inmune específica. Estudios futuros permitirán verificar experimentalmente la localización superficial, como también corroborar su potencialidad como antígenos protectivos en nuevas formulaciones de vacunas racionales. La caracterización del sistema de secreción de proteínas “Twin Arginine translocación pathway (Tat)” aporta nueva información acerca de la funcionalidad del sistema en dos patógenos de gran relevancia: A. marginale y B. abortus. A pesar de que sistema Tat en A. marginale presentan una organización genómica fragmentada, se pudo demostrar la conservación de su funcionalidad en este organismo. Esta organización se opone a la estructura clásica en operon bajo una única secuencia regulatoria característica de la mayoría de los sistemas proteicos multi-componentes. Asimismo, en A. marginale la diferencia de los niveles de abundancia de ARNm de cada uno de los genes correlaciona con los niveles de proteínas descriptos para complejos funcionales, sugiriendo la existencia de una adaptación a mecanismos de regulación alternativos gen-específicos. Las bacterias intracelulares estrictas tendrían un uso limitado del sistema Tat, mientras que organismos de vida libre y bacterias del suelo presentarían un uso moderado a alto. Sin embargo, tanto en A. marginale como en B. abortus el sistema Tat podría estar involucrado en procesos relevantes de adaptación y patogénesis. Los procariotas coordinan la transcripción de genes involucrados en complejos metabólicos o de proteínas mediante la organización de operones. En la actualidad,existen diferentes hipótesis acerca de las fuerzas que rigen estos procesos de organización, tanto para determinar su origen como los mecanismos de mantenimiento de este tipo de estructura. A partir de la fragmentación del operon tat y la adaptación a mecanismos de regulación gen-específicos, como así también de otros casos descriptos recientemente en la literatura, surgió la hipótesis de la existencia de un proceso generalizado de fragmentación de operones en organismos asociados a ambientes intracelulares con genomas reducidos en tamaño. En tal sentido, fue posible comprobar que en las α-proteobacterias de genomas pequeños tanto el número como el largo de los operones era menor en comparación con bacterias de genomas también pequeños pero pertenecientes a otros grupos. Este comportamiento observado en las α-proteobacterias sería compatible con un proceso generalizado de fragmentación. Estos resultados se explicarían teniendo en cuenta que los procesos de reducción genómica se describieron como procesos evolutivos independientes en los diferentes linajes. Del análisis de las diferentes propiedades de los genes presentes en operones en diversos grupos filogenéticos se pudo detectar tanto resultados que reflejan diversidad como patrones consistentes y conservados. La mayor frecuencia de fragmentación supone el incremento de regiones de regulación gen-específicas en genomas de tamaño reducido, y/o en genes bajo escasa presión de selección, como se observa para los genes menos persistentes, de baja expresión y no-esenciales. La aparición de mecanismos de control gen-específico versus un control concertado en operón estaría fuertemente influenciado por los procesos de mutación, selección y deriva. Dada la diversidad de la clase y la complejidad de procesos que afectan y determinan la organización de los cromosomas, el conocimiento acerca de los mismos ayudará a conocer los procesos celulares, moleculares que subyacen a la diversidad. Aspiramos a que los estudios realizados en la tesis aporten al conocimiento general de los organismos del orden Rickettsiales para avanzar en la caracterización de un grupo de bacterias que requiere más atención y estudio como patógenos emergentes de amplia distribución.
tesis Acceso Abierto

Estudios genómicos y transcriptómicos de la adaptación al ambiente de cría en un modelo de especiación por especialización ecológica en Drosophila

Diego Nicolás De Panis ; Esteban Hasson

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Los estudios de secuenciación de alto rendimiento están abriendo nuevos caminos para investigar las respuestas adaptativas que los organismos despliegan en entornos alternativos. Sin embargo, mucho queda por entender sobre las bases genéticas de la adaptación a las plantas hospedadoras. La especies cactófilas de Drosophila que se encuentran en América del Sur tienen distinto grado de divergencia y especialización en la explotación de los cactus que habitan. La utilización de tejidos necróticos como hospedadores ha ligado su historia evolutiva a la expansión, retracción y diversificación de las cactáceas durante los cambios climáticos promovidos por los periodos glaciales del cuaternario. Las especies hermanas D. buzzatii y D. koepferae divergieron hace unos cinco millones de años y actualmente muestran una marcada diferenciación en caracteres de historia de vida, morfología y hábito, que aparentemente habrían evolucionado como adaptaciones a las distintas plantas hospedadoras. En su región simpátrica, ubicada en el noroeste Argentino, utilizan alternativamente cardones (Trichocereus terscheckii) y tunas (Opuntia sulphurea) como recursos de cría, donde el hospedador primario de una resulta en el secundario de la otra. Sin embargo, el cambio de hospedador afecta seriamente los componentes del fitness cuando ambas especies son criadas en el recurso secundario, lo que sugiere un importante papel de los metabolitos secundarios en el proceso de especialización ecológica. En la presente tesis, se estudiaron las particularidades genómicas de estas especies hermanas, así como la expresión génica en diferentes aproximaciones a las condiciones naturales de cría. A partir de los resultados, se desprenden diferencias entre ambas especies, tanto en su arquitectura genética como en su modulación transcripcional. Precisamente la mayor diferencia se encontró en la modulación transcripcional que llevan a cabo en los diferentes recursos de cría, aunque en ambos casos los genes diferencialmente expresados estuvieron principalmente relacionados con detoxificación, óxido-reducción y respuesta a estrés, pero también con desarrollo y procesos neurobiológicos. Esta trabajo aporta nuevos datos sobre el rol de la plasticidad transcripcional y las bases genómicas de estrategias adaptativas a ambientes de cría alternativos.
tesis Acceso Abierto

Estudios geofísicos aplicados a la neotectónica de la falla El Tigre, precordillera de San Juan

Sabrina Yesica Fazzito ; Augusto Ernesto Rapalini ; José María Cortés

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El presente estudio tiene como objetivo principal caracterizar la cinemática, la estructura y la deformación de uno de los rasgos estructurales más destacados en la Precordillera Centro- Occidental de San Juan con actividad neotectónica, la falla con deslizamiento oblicuo El Tigre. Para esto, se mostrará que la aplicación y el desarrollo de diferentes métodos geofísicos, en conjunto con los métodos geológicos tradicionales como el análisis estructural, geomórfico y estratigráfico, permiten ampliar significativamente el conocimiento de una zona afectada por actividad neotectónica. En este trabajo se aplicaron, con resultados positivos, diversos métodos de estudio geofísico en zonas afectadas por la falla: Tomografía Eléctrica Resistiva somera en 2D, Paleomagnetismo y Anisotropía de Susceptibilidad Magnética. Entre los principales aportes de la investigación se encuentran: la identificación de discontinuidades en la traza y geoformas asociadas a fallamiento de desplazamiento de rumbo, el reconocimiento de estructuras oblicuas a la falla, determinación de curvaturas menores y mayores de la traza y la evaluación de la actividad de la falla en el tiempo. En particular en el Segmento Central de la falla El Tigre, la Tomografía Eléctrica Resistiva en 2D reveló características de los sedimentos, la ubicación y orientación de la falla principal, la estructura de dorsos de presión y de bajos de hundimiento y permitió asociar la distribución de esas geoformas a los cambios mayores en la orientación de la traza de la falla. Además, esta metodología permitió sugerir la existencia de fallas ciegas y grábenes, la ubicación de la napa freática y reconocer la función de la falla El Tigre como barrera hidrogeológica. A través del Paleomagnetismo se logró detectar la presencia de zonas con importantes rotaciones tectónicas según ejes verticales asociadas al movimiento de la falla, diferencias en la actividad de la falla en distintos períodos geológicos y, teniendo en cuenta las estructuras oblicuas reveladas en el estudio cartográfico, ayudar a proponer un esquema cinemático preliminar de deformación en bloques. El método de Anisotropía de Susceptibilidad Magnética reveló las direcciones de máximo y mínimo acortamiento de la deformación y una posible variación de orientación de las mismas en el tiempo.
revistas Acceso Abierto

Estudios Geográficos

Identificadores:  ISSN 0014-1496 (impreso) 1988-8546 (en línea)

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La Revista Estudios Geográficos fue fundada en 1940 por el Instituto Juan Sebastián Elcano del CSIC. La revista publica artículos dedicados a la investigación científica en Geografía, noticias y comentarios, y reseñas bibliográficas de actualidad editorial. Desde 2005 se edita bianualmente.
revistas Acceso Abierto

Estudios Geologicos

Identificadores:  ISSN 0367-0449 (impreso) 1988-3250 (en línea)

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Cobertura temática

Desde su aparición en 1945, Estudios Geológicos publica trabajos originales e inéditos de investigación, así como artículos de síntesis, sobre cualquier campo de las Ciencias de la Tierra. Estudios Geológicos se publica en acceso abierto, mediante un volumen anual dividido en dos números semestrales, y es editada por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) en el Instituto de Geociencias (CSIC-UCM).
tesis Acceso Abierto

Estudios geológicos areales y petroestructurales en el complejo deformado de los andes fueguinos

Rogelio Daniel Acevedo ; Bernabé J. Quartino

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Fil:Acevedo, Rogelio Daniel. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina.
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Estudios geológicos en la región del Río Chubut Medio

Cristian Serafín Petersen ; Pablo Groeber

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La presente contribución tiene por objeto optar al titulo de Doctor en Ciencias Naturales. La región abarcada por las observaciones que en ella se consignan se halla comprendida, aproximadamente, entre los 42°20' - 43° L.S. y los 69°30' - 7O°20' Long.W.; ella se ilustra, a grandes rasgos, en el plano de orientación adjunto (fig. 1) confeccionado, con algunas modificaciones, sobre la base de las planchetas del Instituto Geográfico Militar en escala l:500.000, N°s 77 (Esquel) y 78 (Rio Chubut), edición de 1929. Los límites entre las unidades geológicas en él representadas tienen sólo carácter provisorio, dada la poca exactitud del mapa básico en lo referente a distancias relativas, trazados de caminos, cañadones, etc. Una distinción más precisa será factible cuando se disponga de mapas topográficos a mayor escala. Con el fin de establecer más exactamente las relaciones que existen entre los distintos grupos, efectué dos levantamientos topográficos y geológicos expeditivos en escala 1:50.000. Uno de ellos comprende la zona entre Piedra Parada y la casa de R.San Martin, localidades situadas sobre el valle del rio Chubut, y extendido a ambos lados de éste sobre una superficie total aproximada de 430 km²; el otro cubre una franja de unos 340 km² y comprende la región del Cerro Mirador y su continuación al sur hasta el rio Chubut, superponiéndose en parte al primero en las inmediaciones de Piedra Parada, a fin de ensamblar los perfiles y localidades que fueron objeto de estudio detallado. En ambos casos el mapa topográfico fué ejecutado a brújula, nivel inglés y pasos, con lineas de base auxiliares medidas a cinta métrica. Las alturas de estas lineas de base sobre el nivel del mar fueron determinadas hipsométricamente. Los trabajos de campaña se iniciaron con una recorrida preliminar de la zona durante la segunda mitad del mes de abril y primera del mes de mayo de 1940; los relevamientos propiamente dichos tuvieron lugar durante los meses de noviembre y diciembre del mismo año, extendiéndose, con algunas interrupciones, de marzo, abril, noviembre y diciembre de 1941 y marzo-abril de 1942. La finalidad principal de estas tareas consistió en dar cumplimientoa la confección de la hoja 43 e, Piedra Parada, del Mapa Geológico de la República en escala l:200.000, trabajos que se realizan por cuenta de la Dirección de Minas y Geologia del Ministerio de Agricultura de la Nación. Al señor Director de esta Repartición, Ing° D.Tomás M.Ezcurra, debo agradecer sinceramente por habeme autorizado a hacer de las observaciones y colecciones efectuadas en campaña, asi como del material de estudios de gabinete, a fin de llevar a cabo este trabajo de tesis. Séame pemitido asimismo expresar mi profunda gratitud a mi padrino de tesis, el Dr.Pablo Groeber, sin cuya constante guia hubiera sido imposible la ejecución de este trabajo. En dos oportunidades, esto es durante los primeros dias de diciembre de 1940 y el mimo mes de 1941, pude contar con su valiosa supervisión en campaña, habiendo efectuado en su compañía algunas recorridas por la zona de estudios y regiones adyacentes. A mi profesor de Paleontología, prof. D.Martin Doello-Jurado, agradezco particulamente por habeme conducido en la determinación de los fósiles marinos, así como al prof. D. AleJendro F. Bordas, del Museo Argentino de Ciencias Naturales, por el amable interés con que estudió los restos fósiles de Mamíferos de mis colecciones. Finalmente, agregaré que las dificultades que se presentaron en la ejecución de mis tareas censistieron, principalmente, en la necesidad de formar tropas de animales, de por sí muy escasos en la zona, para el traslado de los campamentos,y en la falta sensible de personal. Fuera del valle del río Chubut, el impedimento de mayor consideración estribó en la carencia de esta y pastaje, lo que obligó a dar cierta celeridad al trabajo, quizá en detrimento de la precisión del mismo.