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Título de Acceso Abierto
Estudio teórico-experimental de migración y unión de ligandos pequeños en hemoproteínas
Fernando Martín Boubeta Dario Ariel Estrin
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Resumen/Descripción – provisto por el repositorio digital
Las hemoproteínas se encuentran en todos los organismos vivos y tienen una gran variedad de funciones, desde el transporte de ligandos hasta fenómenos bioquímicos redox. Las funciones de las hemoproteínas están típicamente asociadas a la interacción con pequeños ligandos, como O2, NO, HNO, H2S, O2-, etc. Una de las etapas fundamentales de esta interacción son la migración del ligando a través de la matriz proteica y su posterior unión al centro metálico del hemo. Estos procesos pueden limitar la velocidad del proceso global, con su consecuente impacto biológico sobre el organismo en que se encuentra la hemoproteína. La complejidad de las hemoproteínas en función de su estructura, o condiciones del medio (temperatura, presión, etc) requieren de la utilización de diversos enfoques para abordar un estudio de los procesos mencionados. El presente trabajo de tesis tuvo como objetivo estudiar, a partir de estudios teóricos, y métodos tanto de simulación computacional como experimentales, el proceso de migración y unión de ligandos a hemoproteínas. En primer lugar, se abordó un estudio teórico sobre los estimadores de energía libre derivados de la ecuación de Jarzynski, para distribuciones de trabajo generalmente obtenidas en simulaciones de dinámica molecular guiada, tomando como caso paradigmático la migración de ligandos en metaloproteínas. En segundo lugar, se estudió mediante diversas técnicas de simulación computacional clásica y multi-escala cuántico-clásica (QM/MM) la especiación de especies de sulfuro (H2S) en hemoproteínas, utilizando además las metodologías desarrolladas en el primer capítulo. Finalmente, se estudió mediante técnicas experimentales de láser flash fotólisis el efecto de la temperatura en la migración y unión de ligandos diatómicos en hemoglobinas truncadas pertenecientes a bacterias que habitan en condiciones diferentes de temperatura: P. Haloplanktis, B. Subtilis, y T. Fusca, que son consideradas psicrófilas, mesófilas, y termófilas, respectivamente.Palabras clave – provistas por el repositorio digital
HEMOPROTEINAS; PEQUEÑOS LIGANDOS; MIGRACION; DINAMICA MOLECULAR GUIADA; ECUACION DE JARZYNSKI; DINAMICA MOLECULAR; QM/MM; CINETICA DE LASER FLASH FOTOLISIS; CONSTANTES DE ASOCIACION KON; HEME PROTEINS; SMALL LIGANDS; MIGRATION; STEERED MOLECULAR DYNAMICS; JARZYNSKI EQUALITY; MOLECULAR DYNAMICS; LASER FLASH PHOTOLYSIS; ASSOCIATION RATE CONSTANT KON
Disponibilidad
| Institución detectada | Año de publicación | Navegá | Descargá | Solicitá |
|---|---|---|---|---|
| No requiere | 2017 | Biblioteca Digital (FCEN-UBA) (SNRD) |
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Información
Tipo de recurso:
tesis
Idiomas de la publicación
- español castellano
País de edición
Argentina
Fecha de publicación
2017-03-10
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